厭氧主要是提高水的生化學，其功能也是釋放磷，使污水中磷的含量濃度升高，讓溶解性有機物被物生物細胞吸收使水中的BOD濃度下降，氨氮也因細胞的合成而被去除一部分，這樣水中的氨氮濃度也會下降，但硝化氮含量沒有變化。在缺氧池中，反硝化菌利用污水中的有機物作為碳源，將回流混合液中帶入大量的硝化氮和亞硝酸鹽氮，還原為氮氣釋放到空氣，因此BOD濃度下降，硝態氮濃度大幅度下降，而磷的變化不大。在好氧池中有機物被微生物生化降解，有機物氮被氨化然后被硝化，使氨氮濃度明顯下降，但隨著消化過程使硝化氮的濃度增加，磷隨著聚磷菌的大量攝取，以較快的速度下降。

   AAO工藝它可以同時完成有機物的去除，硝化脫氮 除磷等功能，脫氮的前提硝化氮要完全被硝化，好氧池可以完成這一功能，缺氧池則完成脫氮功能，厭氧池和好氧池聯合完成除磷功能。