大顆粒在曝氣的情況下可能會導致膜絲的劃傷，而毛發和纖維組織的累積并纏繞在膜絲根部導致膜絲根部的膨脹，造成難以修復的損傷。所以在進入膜池或反應池之前必須進行相應的預處理。通常在供給原水處設置一個孔小于1.5mm以下回轉式機械格柵。MBR污水處理工程進水應設置格柵，進入膜池前應設置超細格柵，城鎮污水預處理還應設沉砂池。當進水中含有毛發，織物纖維較多時，必須設置毛發收集器或超細格柵。